Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPAG4Q9NPE6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms