Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms