Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms