Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms