Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOJQ9H4E5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHOJQ9H4E5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHOJQ9H4E5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHOJQ9H4E5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms