Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms