Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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