Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms