Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms