Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms