Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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