Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECSITQ9BQ95 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms