Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms