Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PIK3R4Q99570 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms