Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms