Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms