Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms