Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms