Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf85Q96MD7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms