Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms