Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms