Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms