Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARF2Q96GP6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms