Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms