Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms