Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms