Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms