Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms