Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms