Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms