Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3AQ92664 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms