Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms