Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms