Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms