Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms