Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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