Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms