Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD53Q8N9V6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms