Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms