Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms