Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms