Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms