Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFPL4BQ6ZWI9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms