Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC149Q6ZUS6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms