Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL4Q6ZR62 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL4Q6ZR62 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms