Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXPE4Q6UWF7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms