Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF7Q6Q0C0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF7Q6Q0C0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF7Q6Q0C0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF7Q6Q0C0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF7Q6Q0C0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF7Q6Q0C0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF7Q6Q0C0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms