Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms