Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS3Q68E01 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms