Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA77

LCE3B, Late cornified envelope protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3BQ5TA77 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AL049812.2-201ENST00000431589 594 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 TMEM161B-207ENST00000509387 963 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 IMPA1P1-202ENST00000522318 332 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 GLTP-205ENST00000544393 914 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 RN7SL387P-201ENST00000581015 273 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 GDPD1-206ENST00000581276 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 IGFL4-204ENST00000601672 667 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 PCAT14-203ENST00000629869 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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LCE3BQ5TA77 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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LCE3BQ5TA77 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 LRRC18-201ENST00000374160 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AL359475.1-201ENST00000414505 292 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LCE3BQ5TA77 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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